魔王馬他呂再次活了過來，但仍然無止境地在沈睡中。

生化戰士們飛到宇宙的核心加達呂島，終於把他從沈睡中喚醒。抵島後，他們發現 馬古他與 同盟已經侵入核心，並且運用吸血至 蛭把其中三位光明勇者變成邪惡的黑暗戰將！

極天之戰快將展開，生化戰士 和 馬古他 同盟都必須和自己的 智者並肩作戰！無論是正義或邪惡的一方，都必須讓矮小的光明勇者或黑暗戰將 (Matoran) 騎在高大的 生化戰士或異極天魔 (Phantoka) 的背上，這樣才能和自己的新盟友合體作戰，盡顯無窮威力！